¿Le pagaste a una persona que vendía una moto, que no es el dueño y dice serlo ...(¿tiene algún documento que lo certifique?), sin transferencia y tu deberás ubicar al legítimo dueño para ver si acepta hacerte la transferencia? 
Antes de meterle plata.... soluciona eso, conozco ese tema con los autos antiguos y a veces es imposible.
Dueño y quien es el único que está facultado para vender, es aquel que figura en los papeles como titular de la moto...... el resto pueden ser sólo cachos a corto plazo y plata perdida.
Sin eso en regla, no podrás usarla y siempre arriesgando meterte en un lío, no fácil de salir. 
la venta de cosa ajena vale pero no es oponible al verdadero dueño
la primera opcion es ubicar al propietario registrado en el padron, y decirle que tu pagas todo que solo necesitas que firme....
si no resulta eso.... que recomiendo, hacer un documento en el que se venda la moto, de manera que conste por escrito (poder probarlo), con testigos.. entre el que te vendio y tu, los testigos para despues certificar la fecha, deben ser al menos dos, para que esten contestes.
transcurridos tres años puedes solicitar al juez de letras en lo civil que declare que tu eres el legitimo dueño de la moto pues si bien es cierto tienes un titulo imperfecto, ha transcurrido el plazo legal para que el legitimo propietario pueda oponerse a las acciones por lo que tu adquiriste la moto en el peor de los casos por prescripción. (esta jugada no te va a ser tan barata pues debes contratar abogado y hacer un juicio, aunque no son tan largos)mas barato te va a salir que ubiques al "dueño legal" pero si no resulta aplicas nomas...
(los autos son bienes muebles, su dominio se transfere conforme a las reglas de los bienes muebles, lo que ocurre es que hay un sistema registral, de hecho si miran sus padrones ninguno dice "certificado de dominio" si miran sus certificados de anotaciones vigentes ninguno dice "certificado de dominio", solo dice "propietario", por lo que en juiciom, es perfectamente posible demostrar una compraventa por un contrato no notarial por escrito con testigos, mas declaracion de testigos contestes que la moto el ue te la vendio la tenia hacia mucho tiempo.
El "legitimo" propietario, sera notificado de la accion, evidentemente, pero si de verdad vendio la moto (y mas encima la moto esta pa la cagada), lo mas probable es que se allane a la demanda, o pierda el juicio, especialmente si nunca inicio ningun tipo de accion para recuperar la motocicleta con anterioridad a la demanda. (te recomiendo una consulta por el rut del propietario "legal" en poder judicial.cl para ver si tiene iniciada alguna accion reivindicatoria sobre la moto, y una consulta de si tiene encargo por robo)