Los contratos son consensuales y se dan por hecho por el solo acuerdo de las partes.
Por lo tanto, si no firmaste el anexo y tu jefe te dijo que ya lo era, quedate tranquilo.
Ahora, si tienes dudas porque son medios turbios, asegurate de registrar la asistencia como corresponde y de guardar un respaldo (tickets del sistema biometrico, fotocopia simple del libro de asistencia, correos electronicos, etc.)
Tampoco está demás que le pidas la escrituración del anexo y si se niega... run forrest, run!