Legalmente es el comprador el que debe efectuar el trámite, y lo único que se necesita para ello es que presentes el contrato de compraventa en el registro civil. Tienes ese contrato debidamente firmado por comprador y vendedor? ese es el documento importante que tienes que tener en tu poder si o si.
Ahora, tu delegaste el trámite (y pagaste supongo) en la automotora, esto es usual y no es problemático, lo más probable es que esté atrasado nomás, pide a la automotora que te muestren el comprobante del trámite (puede que solo falte que llegue el padrón, que si se hizo el trámite puedes pedir una copia en cualquier RC) o si no lo han hecho y te preocupa que te devuelvan la plata y lo haces tu mismo.