Yo creo que lo mejor es dejarlo así, o las partes mas hundidas solamente tirarlas hacia afuera con golpes de martillo no muy fuertes, tampoco es tan débil un cárter como para que s rompa con un martilleo.
Aunque será mejor buscarte uno en desarmadurías y cambiarlo, yo por ejemplo, con el cárter del renault 5 siempre tuve problemas de fugas, incluso después del ajuste, le pusimos doble empaquetadura, full silicona, y aun asi fugaba un poco, por que??? por que estaba demasiado abollado, a tal punto de tener deformaciones en la superficie que se une al block, la base estaba dispareja, el auo lo vendí asi, nunca cambié el carter por que no lo encontré, asiq ue te sugiero que si puedes encontrar un carter en buen estado, lo cambies