Respecto de tu pregunta, cualquier cambio de condición ya sea sueldo, jornada, etc, etc requiere una modificación de contrato, en algún momento deberías haber firmado esta modificación. Si no te la pasaron tampoco es problema ya que en tus liquidaciones está la info que la inspección necesita, es más, también puede multar a la empresa por no tener al día los contratos.
Respecto de los consejos que dieron más arriba, realmente no los comparto, tu tienes tu posición clara y nada que ocultar, mientras más info tenga la IT mejor te va a asesorar, su misión es la de defender al trabajador frente a una empresa tal como un abogado defensor. Además si no les cuentas van a ir a la empresa y lo primero que les van a decir es que estabas de viaje y no van a estar preparados para defender ese caso.
Por último, en mi humilde opinión, lo único que uno tiene es su prestigio y no vale la pena perderlo, menos en un mercado tan chico donde te vas a topar muchas veces con la misma gente. A todo esto a què te dedicas, para ver si hay algo por acá...