NO da lo mismo, más sencillo es efectuarlo en el Registro Civil.
Cuando colaboré a un pariente mío a comprar un vehículo, le exigí al comprador hacer el trámite en dicho lugar. No se hizo ni un problema, todo lo contrario. A pesar que el vendedor tenía un CAV reciente (Cert. de Inscripción y Anot. Vigentes), cuando estaban esperando para dicha diligencia (había un comprador y vendedor antes que nosotros, que se demoraron y por lo visto no hubo transferencia), yo solicité uno nuevo, así como uno de multas no pagadas. Fuimos a pagar el impuesto, Se solicitó la transferencia y antes de entregarme los documentos, llaves y el nuevo certificado de inscripción (amarillo), se entregó el dinero. Así te evitas un doble viaje (Para qué ir a la Notaría si igual deberás pasar a alguna oficina a solicitar la Transferencia), además de reducir los temores naturales, de que en entre los tiempos en ir a la notaría y Registro Civil se inscriba otra transferencia, los documentos no sean auténticos, entre otros. (aparte de revisar el estado mecánico del vehículo).
Claro que si escasea ese recurso tan escaso (tiempo), y no dan otra posibilidad que consideras no se debe dejar pasar, notaría!.