Entre los dos yo prefiero el swift, por look mas que nada, y por que también encuentro que está mejor armadito y el andar es mas "aplomado" que el yaris, aunque el gran pero de los swift son los grillos que producen en su interior, pero todo depende del cuidado y de lo fino que tengas tu oído.
Ambos son confiables, ambos tienen rendimientos y valores de repuestos similares, en equipamiento el swift por lo general anda un poco mejor, de ir por un swift yo iría por el 1.5 si, gasta casi lo mismo que el 1.3 y se mueve mejor, el yaris en lo personal no me gusta la sensación de andar que tiene, se siente muy poco robusto por así decirlo, aunque mecánicamente nada que decir.
En que fijarte? que yo sepa, ninguno de los dos modelos tienen algo en que poner mayor atención al revisarlos, solamente revisar todos los puntos críticos, ruidos, estado de amortiguadores, neumáticos, que no se vean instalaciones eléctricas irregulares, el paso de cambios que sea suave, el ralentí parejo, inspección visual de humos, revisar fluídos, carrocería, etc etc etc.
Te recomiendo que, si no le pegas a la mecánica, te hagas asesorar, yo ayudo a buscar usados y pucha que se encuentran waters maquillados para venta, lo peor es que hay gente que igual cae.
Suerte en la búsqueda, y otra cosa, cualquiera de los dos que compres, asegúralo de inmediato, revisa las listas de vehículos mas robados o cotiza repuestos de carrocería de ambos y me entenderás.